Megaprime DNA 标记系统可将模板 DNA 标记为相同的高比放活性，但速度大大加快。

• 可在 10 分钟内通过标记 DNA 探针获得 > 1 × 10⁹ dpm/μg 的比放活性。
• 在随机引物标记技术中采用了克隆的 Klenow 片段和随机九聚体。
• 杂交前无需去除未掺入的核苷酸。
• 可从低熔点琼脂糖中直接进行标记。