作者:Qiang, Wang et al.
发表日期:2015年11月
发表期刊:Molecular Therapy- Method & Clinical Developemnt


研究背景

随着越来越多以AAV载体为基础的治疗候选药物、具有多向性的新型AAV的发现及其在临床试验中应用的日益增加,迫切需要大规模GMP级的AAV载体生产工艺,以生产纯化多种血清型的AAV。人们探索多种纯化AAV载体的方法,主要包括有基于氯化铯和碘沙醇梯度的浮力密度离心,以及基于层析的技术,例如体积排阻、离子交换和亲和层析及其组合。

其中AVB填料可用于捕获AAV1、AAV2、AAV3和AAV5,例如从杆状病毒-昆虫细胞的细胞裂解液中纯化AAV1。尽管AVB填料可以纯化上述AAV血清型,但对它们的亲和力是有所不同的,文章通过序列对比、结构分析和与AVB填料的结合实验成功鉴定了AVB填料与AAV的特征性结合表位,该表位的存在和缺失解释了不同血清型与AVB结合的差异。

结合表位的鉴定可避免在后续实验中需要重新选用其他血清型AAV的情况下,更换纯化方案的风险。对于与AVB填料结合性较差的AAV血清型,更换表位可能是一种可行的解决方案,使得多种血清型的通用纯化工艺的建立成为可能。

实验方法

构建pAAV2/8, pAAV2/rh.64R1, pAAV2/9和pAAV2/3B表达质粒。使用定点诱变试剂盒对这些质粒进行诱变。当HEK293细胞生长85%时,用聚乙烯亚胺通过三重质粒鸡尾酒法转染到细胞中。转染5天后,收集细胞培养上清液,用核酸酶进行消化。使用切向流过滤,浓缩经0.5 M NaCl处理的上清液,使用碘二醇梯度密度离心后,通过超滤管将样品置换到含有0.35 mM NaCl的DPBS缓冲液中,加入5%甘油,-80℃保存备用。对于需要纯化的样品,在切向流过滤步骤,直接使用AVB.A Buffer (pH 7.5的20mM Tris,0.4 M NaCl缓冲液) 进行缓冲液置换,样品保存在4℃,使用前使用0.22 µm滤膜进行过滤。

将不同血清型AAV载体分别加载到HiTrap AVB Sepharose High Performance 1 mL预装柱中,使用6 CV的AVB.A Buffer (pH 7.5的20 mM Tris,0.4 M NaCl缓冲液) 进行平衡,再使用3 CV的AVB.C Buffer (pH 7.5的20 mM Tris,1 M NaCl缓冲液) 进行洗杂,最后使用3 CV的AVB.B Buffer (pH 2.5的20 mM 柠檬酸钠,0.4 M NaCl缓冲液) 进行洗脱,洗脱收集管中预放有1/10体积的BTP Buffer (pH 10.0,0.2 M Bis-Tris-propane缓冲液) 进行中和,整个纯化过成使用0.7 ml/min流速进行。

纯化结果分析显示,rh.10、hu.37、rh.64R1、AAV8、AAV3B这几种血清型AAV中,rh.64R1、AAV8在AVB上的结合相对较弱,rh.10、hu.37在AVB上的结合相对较好,在AAV3B上最好。在经过序列替换,改造了rh.64R1、AAV8、AAV9中VP1中665-670号序列,替换成AAV3B对应序列表位,诱变后的AAV明显对AVB填料的亲和性变强,同时,也做了反向对比,将AAV3B 665-670号序列替换成了AAV9对应序列表位,发现亲和性有一定程度降低,说明665-670号位置序列不同影响不同血清型AAV对AVB填料的亲和性。

后续将AAV野生型和突变型在Huh7细胞中进行转导分析,结果显示,将原来对AVB亲和性差的AAV血清型的表位替换后,不仅不影响其在细胞中的转导 (传染性),同时还可以增加其对AVB填料的亲和性。

产品信息

类别 货号 产品名称 规格
预装柱 28411211 HiTrap AVB Sepharoose HP 5×1 mL

Reference
Qiang, Wang, Martin, et al. Identification of an adeno-associated virus binding epitope for AVB sepharose affinity resin[J]. Molecular Therapy - Methods & Clinical Development, 2015.