作者:Piyachat Roop-ngam et al.
发表日期:2012年7月
发表期刊:Biochemical and Biophysical Research Communications


研究背景

草酸钙calcium oxalate (CaOx) 是肾结石的主要晶体成分,研究表明肾结石的形成可能与肾脏中草酸结合蛋白有关。通过EAH Sepharose 4B预活化填料偶联上草酸分子,可以从肾脏组织匀浆液上清中垂钓出与草酸结合的蛋白,通过双向电泳和质谱技术,进一步鉴定蛋白的序列和名称,确定是否参与结石过程。 利用2-DE双向电泳技术,结合阴性对照,找到了38个可以结合草酸的蛋白。经过Q-TOF MS质谱鉴定出共有28个unique 蛋白。通过PRATT tool比对工具,找到了L-x(3,5)-R-x(2)-[AGILPV]的氨基酸序列为草酸结合结构域。

实验方法

用0.24 g的草酸分子用3.6 ml的50% (w/v) dimethylformamide 溶解,与3 mL的EAH-Sepharose 4B填料进行偶联,将猪的肾脏组织,切成薄片后用PBS进行清洗,在用液氮速冻后,进行研磨成粉末,粉末用Tris pH 6.5溶解后用12000 g离心5min取上清液。含3 mg总蛋白的组织上清液用偶联了草酸的预活化填料进行垂钓,在用10 mM MES pH 6.5,150 mM NaCl,2 mM MgCl2,2 mM CaCl2,5 mM KCl清洗非特异结合的杂质后,用10 mM MES pH 6.5,150 mM NaCl,2 mM MgCl2,2 mM CaCl2,5 mM KCl,1 M NaCl,1 mM oxalic acid 洗脱下来。同时做一组阴性对照,即用没有偶联草酸的预活化填料同时进行一次垂钓步骤。

产品信息

类别 货号 产品名称 规格
填料 17056901 EAH Sepharose 4B 50 mL
空柱 28988937 Column XK 16/20 16/20

Reference
Roop-ngam P, Chaiyarit S, Pongsakul N, Thongboonkerd V. Isolation and characterizations of oxalate-binding proteins in the kidney. Biochem Biophys Res Commun. 2012 Aug 3;424(3):629-34. doi: 10.1016/j.bbrc.2012.07.015. Epub 2012 Jul 14. PMID: 22796524.